Mematikan system Linux tentu sama prosedurnya dengan sistem oprasi lain, yaitu melalui proses reboot atau shutdown terlebih dahulu. Sebenarnya tindakan tersebut adalah untuk mengindari kerusakan baik pada data, ataupun pada perangkat keras harddisk. Perintah untuk mematikan system linux sebagai berikut :
• halt
• Init o
• shutdown –h now
untuk keluar dari Linux dan melakukan reboot, jika pengguna berada pada mode teks, dapat langsung menekan tombol CTRL+ALT+DEL ataupun mengetikan perintah berikut :
reboot
• init 6